0. Понадобится программа mkvtoolnix , надёжную версию для windows можно скачать -> тут <- , за свежими версиями можно ходить туда. Там же можно скачать версию для никсов, интерфейс и принципы работы программы под никсами абсолютно идентичны окошечной версии.
1. После установки программы mkvtoolnix в меню Пуск->Программы появится пункт MKVtoolnix. Для создания сампла нужно запустить Пуск->Программы->MKVtoolnix->mkvmerge GUI. Теперь нужно перетащить исходный файл .mkv в окно программы, в котором появится список всех видео/аудиодорожек и субтитров

2.Внизу окна в поле Output filename выбрать, куда надо сохранить результат

3. Перейти на закладку Global, отметить флажок Enable Splitting

4. Можно разрезать на равные куски, например чтобы порезать на куски по 10Mb, надо в поле ...after this size ввести 10M и нажать Start muxing
5. Чтобы вырезать определённый фрагмент, надо в поле ...after timecodes ввести через запятую таймкоды нужного фрагмента, например чтобы вырезать кусок с 05м30с по 7м25с надо ввести 00:05:30,00:07:25 и нажать Start muxing (нужные таймкоды можно подсмотреть в любом плеере при воспроизведении)

6. После нажатия на кнопку start muxing появится окно прогресса, программа будет последовательно записывать куски в файлы вида фильм-001.mkv, фильм-002.mkv и т.д. Если вырезаем фрагмент по таймкодам, то очевидно самплом будет файл фильм-002.mkv. В случае нарезки по размерам можно выбрать любой из получившихся фрагментов.

Прим.
очевидно, что не обязательно дожидаться, пока программа нарежет матрёшку целиком, достаточно дождаться готовности нужного кол-ва нарезанных файлов на выбор либо готовности второго файла, если нарезаем по таймкодам. После этого можно нажать Abort и удалить ненужные файлы.

полученные самплы не будут одинакового размера и в случае нарезки по таймкодам не будут точно попадать в указанные моменты. это свзяано с тем, что видеопоток может быть разрезан только в определённых точках.